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PCR技術:PCR污染及對策

更新時間:2025-05-30      點擊次數(shù):189

在PCR實驗中,污染是一個常見且嚴重的問題,可能導致假陽性結果,影響實驗的準確性和可靠性。為有效預防和處理PCR污染,需遵循以下注意事項:

一、實驗分區(qū)與操作流程

合理劃分實驗區(qū)域:將實驗分為標本處理區(qū)、PCR反應液制備區(qū)、PCR擴增區(qū)和產(chǎn)物分析區(qū),各區(qū)域應有明確的隔離和方向性,避免交叉污染。

單向工作流程:從預PCR到后PCR,實行“單向"工作流程,確保在后PCR區(qū)域引入的耗材和防護裝備不會未經(jīng)消毒就回到預PCR區(qū)域。

試劑與樣品分離:PCR試劑、PCR反應液應與樣品及PCR產(chǎn)物分開保存,不應放于同一冰盒或冰箱。

二、試劑與材料準備

試劑分裝:所有PCR試劑應在超凈工作臺或負壓工作臺配制和分裝,使用專用加樣器和吸頭,避免交叉污染。

試劑儲存:實驗室自配的試劑(如去離子水、緩沖液等)在使用前應高壓滅菌或過濾除菌。

試劑小量分裝:PCR試劑應小量分裝,以減少重復取樣次數(shù),并置于-20℃保存。

三、實驗操作規(guī)范

正確佩戴防護裝備:實驗過程中應戴一次性手套,若不小心濺上反應液,立即更換手套。

避免氣溶膠污染:操作時應勤換手套,進出不同區(qū)域或進行模板操作后應及時更換手套;開管動作要輕,以防管內(nèi)液體濺出或形成氣溶膠。

減少操作污染:在同時進行多個PCR反應時,應制備主反應混合液,再分裝至PCR反應管,最后添加樣品核酸模板,以減少單個添加操作繁瑣造成的污染。

使用防濺污染的吸頭:使用防濺污染的移液器吸頭,減少樣本或試劑中的氣溶膠形成

四、污染監(jiān)測與處理

設立對照實驗:設立陰陽性對照和空白對照,監(jiān)測反應體系各成分的污染情況,選擇合適的對照樣品。

污染識別:使用“無模板對照"(NTC),其中NTC孔包含所有qPCR反應組件,但不包含DNA模板。如果在NTC孔中觀察到擴增,可能表明反應組件中存在污染。

污染處理:若發(fā)生污染,應設立陰陽性對照監(jiān)測污染情況,排除試劑污染后,考慮環(huán)境污染的可能性,通過追蹤實驗查找污染源,必要時更換實驗場所或重新設計引物。

五、實驗室清潔與消毒

定期清潔:實驗結束后對操作臺面、儀器、實驗用具及環(huán)境進行清潔,避免污染。

消毒措施:使用10-15%的漂白溶液(次氯酸鈉)擦拭表面,讓漂白劑作用于表面10至15分鐘后,用去離子水擦拭,最后用70%酒精浸濕的紙巾快速干燥表面。

設備消毒:定期消毒用于準備qPCR反應的表面和設備,包括工作臺面、移液器、冰箱/冷凍室把手、離心機、渦旋器和其他觸點。

六、污染控制技術

UNG法:使用尿嘧啶糖苷酶(UNG)去除PCR產(chǎn)物中的污染,優(yōu)點是能去除任何來源的污染,且UNG處理可與PCR擴增在同一反應管內(nèi)進行

DNase I法:采用DNase I法處理反應液污染,適用于去除污染DNA。

固相捕獲法:利用生物素標記的單鏈RNA探針與待擴核酸雜交,再用包被鏈霉親和素的固相載體捕獲雜交核酸,從而去除污染

七、其他注意事項

實驗記錄與驗證:堅持常規(guī)清潔工作,設計陰性對照組,連續(xù)三天陰性對照沒有起跳,則污染得到控制。

人員培訓:所有操作人員應接受嚴格培訓,確保操作規(guī)范,減少人為污染風險。

通過以上措施,可以有效預防和處理PCR污染,確保實驗結果的準確性和可靠性。


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